O PPG FARMABIO inclui atualmente 11 laboratórios e um núcleo de pesquisa biomédica com equipamentos adequados e disponíveis ao desenvolvimento das linhas de pesquisa do programa. Esses laboratórios possuem os equipamentos necessários para diversas atividades, como avaliações biológicas na área comportamental e de inflamação, dosagem de biomarcadores bioquímicos de poluição aquática e análises bioquímicas em geral, análise de erros inatos do metabolismo, estudo de alterações bioquímicas e farmacológicas nos seres vivos em condições fisiológicas ou devido a patologias ou uso de substâncias, avaliações farmacológicas e toxicológicas de compostos naturais. Conta ainda com diversas salas de laboratórios equipadas para desenvolvimento de pesquisas em interação com o setor privado no Parque Tecnológico da UFPA (preparo de amostras; de análises físico-químicas; de análises microbiológicas; de biotecnologia vegetal e biologia molecular; de análises cromatográficas e espectrométricas; de análises sensoriais e de bioprocessos).
Esses espaços possuem ainda 4 biotérios para experimentação animal com roedores (camundongos e ratos) adequadamente ambientados e cadastrados, sendo um deles multiusuário diretamente gerenciado pelo PPG FARMABIO, com equipamentos para análises comportamentais e metabólicas (campo aberto, gaiolas metabólicas, nado forçado, labirinto aquático (teste de Morris), plano inclinado, pole-test, registro e análise automático de imagens e rotarod, entre outros). Alguns dos laboratórios abrigam salas de seminários para audiência até de quinze pessoas, com computador e datashow disponíveis. Ainda, o Programa conta com ambientes separados para os diversos tipos de análises relacionadas às linhas de pesquisa, com equipamentos e materiais, para coleta, processamento e conservação de material biológico para avaliação tecidual ou bioquímica (ultrafreezers, capelas de exaustão, balanças, sonicadores e banho ultrassônico, e criostato, entre outros), bem como para o desenvolvimento de análises genéticas (sistemas de PCR), de biologia molecular (sistemas de eletroforese e transferência, e sistemas de captura de imagens digitalizadas), bioquímicas em geral (espectrofotometria e fluorimetria), eletrofisiológicas (patchclamp, gaiola de faraday, osciloscópio, placa de aquisição) e cultura de células primarias e secundárias (incubadoras, autoclave, cabines de fluxo laminar). O PPG conta ainda com laboratório equipado para o serviço de diagnóstico a doenças do metabolismo. Dentre os equipamentos de médio e grande porte, destacamos a presença de ultrafreezeres, microscópios de fluorescência com captação de imagem, citômetro de fluxo, leitor de ELISA e lavadora de placas, cintilador líquido (para manuseio de radioisótopos), microscópio invertido de fluorescência com sistema de imageamento de cálcio, fluorímetros, centrífugas e microcentrífugas refrigeradas, e criostato. Conta ainda com dependências de um Laboratório Multiusuário com microscopia de alto porte (MET e microscópio confocal) e suporte estrutural e técnico acessível para os grupos de pesquisa.